Enquanto isso, os estudantes estão sob ataque de um adversário muito diferente, já que os hormônios adolescentes se fizeram notar. Harry se vê cada vez mais atraído por Ginny, mas o mesmo acontece com Dean Thomas. E Lavender Brown decidiu que Ron é o homem da vida dela, mas não contou com os chocolates de Romilda Vane! E há Hermione, se mordendo de ciúmes, mas determinada a não demonstrar seus sentimentos. À medida que o romance se espalha, um estudante permanece imune. Ele está determinado a deixar sua marca, por mais que seja uma negra. O amor está no ar, mas a tragédia está próxima – e Hogwarts pode nunca mais ser a mesma.
 

Em Harry Potter e o Príncipe Misterioso, os jogadores voltarão a Hogwarts para ajudar Harry a sobreviver a um carregado sexto ano. Terão a chance de participar de excitantes duelos bruxos, misturar e fermentar ingredientes na aula de Poções e lançar-se ao ar para levar a equipa de Quidditch dos Gryffindors à vitória. Os jogadores podem até mesmo se perder nas confusões românticas de Ron enquanto caminham em direção ao clímax e descobrem a identidade do Príncipe Mestiço.

1. Removendo Sujeira: limpe a sujeira de Fred e George n'A Toca
2. Usando o Pensador: veja a primeira memória de Dubledore sobre Tom Riddle na Penseira
3. Capitão de Quidditch: monte a equipa de Quidditch dos Gryffindors.
4. Óptima Festa: crie uma óptima festa de Natal para Slughorn
5. Bela Façanha: ajude um estudante a recuperar sua Bexiga (Gobstone)
6. Grande Colega: ajude Ron a evitar Lavender.
7. Esconda o livro: esconda o livro de poções do Príncipe Mestiço
8. Novato no Quadro: use seu primeiro atalho através de um quadro
9. Profissional dos Quadros: use todos os atalhos por quadros
10. Aventura Completa: conclua a aventura
11. Coleccionador de Brasão 1: Complete o Brasão Nível 1
12. Coleccionador de Brasão 2: Complete o Brasão Nível 2
13. Coleccionador de Brasão 3: Complete o Brasão Nível 3
14. Coleccionador de Brasão 4: Complete o Brasão Nível 4
15. Coleccionador de Brasão 5: Complete o Brasão Nível 5
16. Coleccionador de Brasão 6: Complete o Brasão Nível 6
17. Coleccionador de Brasão 7: Complete o Brasão Nível 7
18. Coleccionador de Brasão 8: Complete o Brasão Nível 8
19. Coleccionador de Brasão 9: Complete o Brasão Nível 9
20. Coleccionador de Brasão 10: Complete o Brasão Nível 10
21. Coleccionador de Brasão 11: Complete o Brasão Nível 11
22. Coleccionador de Brasão 12: Complete o Brasão Nível 12
23. Coleccionador de Brasão 13: Complete o Brasão Nível 13
24. Coleccionador de Brasão 14: Complete o Brasão Nível 14
25. Aprendiz em Poções: ganhe a medalha de sorte de iniciante em Poções
26. Medalha de Preparador Rápido: ganhe a medalha de rápido preparador
27. Estrela do Clube de Poções: ganhe a medalha de Estrela do Clube de Poções
28. Veterano no Clube de Poções: ganhe a medalha de Veterano do Clube de Poções
29. Mestre de Poções: ganhe a medalha de Mestre de Poções
30. Aprendiz de Duelo: ganhe a medalha da Sorte de iniciante em Duelo
31. Medalha de Reflexo: ganhe a Medalha do Reflexo
32. Campeão de Duelo: ganhe a medalha de Campeão do Clube de Duelo
33. Veterano de Duelo: ganhe a medalha de Veterano de Deulo
34. Medalha de Mestre Duelista: ganhe a medalha de Mestre Duelista
35. Iniciante em Quidditch: ganhe a medalha da sorte de iniciante em Quidditch
36. Medalha de Voador Preciso: ganhe a medalha de Voador Preciso
37. Medalha de Combo Voador: ganhe a medalha de Combo Voador
38. Medalha de Voador Apurado: ganhe a medalha de Voador Apurado
39. Mestre do Vôo: ganhe a medalha de Meste do Võo
40.  Missão Secreta: continue jogando para desbloquear esta missão secreta
41. Missão Secreta: continue jogando para desbloquear esta missão secreta
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43. Missão Secreta: continue jogando para desbloquear esta missão secreta